Protein–RNA interactions for Protein: B1AVU6

Gm436, Predicted gene 436, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm436B1AVU6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm436B1AVU6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm436B1AVU6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm436B1AVU6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm436B1AVU6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm436B1AVU6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm436B1AVU6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm436B1AVU6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm436B1AVU6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm436B1AVU6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm436B1AVU6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm436B1AVU6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm436B1AVU6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm436B1AVU6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm436B1AVU6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm436B1AVU6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm436B1AVU6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm436B1AVU6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms