Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms