Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms