Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll11A4Q9F4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms