Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms