Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Gm6880A3KG45 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Gm6880A3KG45 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Gm6880A3KG45 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Gm6880A3KG45 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm6880A3KG45 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm6880A3KG45 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm6880A3KG45 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm6880A3KG45 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm6880A3KG45 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm6880A3KG45 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm6880A3KG45 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm6880A3KG45 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Gm6880A3KG45 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Gm6880A3KG45 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6880A3KG45 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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