Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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