Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Samt1A2BED8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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