Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms