Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms