Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc163A2AGD7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc163A2AGD7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc163A2AGD7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc163A2AGD7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc163A2AGD7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc163A2AGD7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc163A2AGD7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc163A2AGD7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc163A2AGD7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc163A2AGD7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc163A2AGD7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc163A2AGD7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc163A2AGD7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc163A2AGD7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms