Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef6A2A8M8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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