Protein–RNA interactions for Protein: A2A5R2

Arfgef2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef2A2A5R2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arfgef2A2A5R2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Arfgef2A2A5R2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Arfgef2A2A5R2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfgef2A2A5R2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfgef2A2A5R2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfgef2A2A5R2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfgef2A2A5R2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfgef2A2A5R2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfgef2A2A5R2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfgef2A2A5R2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfgef2A2A5R2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfgef2A2A5R2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfgef2A2A5R2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfgef2A2A5R2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfgef2A2A5R2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfgef2A2A5R2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfgef2A2A5R2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfgef2A2A5R2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arfgef2A2A5R2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arfgef2A2A5R2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arfgef2A2A5R2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arfgef2A2A5R2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arfgef2A2A5R2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arfgef2A2A5R2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arfgef2A2A5R2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms