Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm6268A2A3U9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms