Protein–RNA interactions for Protein: A1L0T3

Ssc4d, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc4dA1L0T3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssc4dA1L0T3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms