Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms