Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms