Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv21A0A0A6YX06 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trbv21A0A0A6YX06 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trbv21A0A0A6YX06 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trbv21A0A0A6YX06 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trbv21A0A0A6YX06 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trbv21A0A0A6YX06 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trbv21A0A0A6YX06 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trbv21A0A0A6YX06 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trbv21A0A0A6YX06 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trbv21A0A0A6YX06 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trbv21A0A0A6YX06 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trbv21A0A0A6YX06 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trbv21A0A0A6YX06 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trbv21A0A0A6YX06 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trbv21A0A0A6YX06 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trbv21A0A0A6YX06 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trbv21A0A0A6YX06 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trbv21A0A0A6YX06 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trbv21A0A0A6YX06 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trbv21A0A0A6YX06 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trbv21A0A0A6YX06 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trbv21A0A0A6YX06 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trbv21A0A0A6YX06 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trbv21A0A0A6YX06 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trbv21A0A0A6YX06 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trbv21A0A0A6YX06 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trbv21A0A0A6YX06 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trbv21A0A0A6YX06 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trbv21A0A0A6YX06 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms