Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WR76

Gm28845, Predicted gene 28845 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28845A0A087WR76 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28845A0A087WR76 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms