Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Q0

Ighv5-6, Immunoglobulin heavy variable 5-6 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ighv5-6A0A075B5Q0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ighv5-6A0A075B5Q0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ighv5-6A0A075B5Q0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ighv5-6A0A075B5Q0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv5-6A0A075B5Q0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ighv5-6A0A075B5Q0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv5-6A0A075B5Q0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ighv5-6A0A075B5Q0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ighv5-6A0A075B5Q0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ighv5-6A0A075B5Q0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ighv5-6A0A075B5Q0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv5-6A0A075B5Q0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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