Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm22023-201ENSMUST00000104354 130 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm25728-201ENSMUST00000104525 159 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm27520-201ENSMUST00000184872 81 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm42570-201ENSMUST00000195937 292 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 AC125223.1-203ENSMUST00000225304 498 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Olfr785-201ENSMUST00000204402 2014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Olfr389-201ENSMUST00000122224 3057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm22939-201ENSMUST00000103958 131 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm25308-201ENSMUST00000104171 158 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm22598-201ENSMUST00000157600 127 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Tmem167-ps2-201ENSMUST00000190251 214 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Olfr6-204ENSMUST00000219365 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm5596-201ENSMUST00000207988 2421 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm15697-201ENSMUST00000121946 2902 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm11115-201ENSMUST00000113255 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm14877-201ENSMUST00000119803 478 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm14562-201ENSMUST00000129885 543 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm23474-201ENSMUST00000158884 75 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm4479-201ENSMUST00000178807 171 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 AC154262.1-201ENSMUST00000225976 286 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1097-201ENSMUST00000111576 4705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Ighv3-3-201ENSMUST00000103476 296 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Gm26275-201ENSMUST00000157101 268 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Gm23196-201ENSMUST00000158806 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Gm44073-201ENSMUST00000204173 429 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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Pggt1bQ8BUY9 AC134596.2-201ENSMUST00000222158 171 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 AC241593.1-201ENSMUST00000224768 397 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Mir193a-201ENSMUST00000083461 66 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1162-202ENSMUST00000183862 4800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 n-R5s67-201ENSMUST00000104336 114 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Rpl31-ps14-201ENSMUST00000143596 378 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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