Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1041-ps1-201ENSMUST00000215884 271 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm25698-201ENSMUST00000082897 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Olfr732-202ENSMUST00000213701 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Vmn2r-ps69-201ENSMUST00000173382 2565 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm15302-201ENSMUST00000117779 2630 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm13343-201ENSMUST00000116474 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm23956-201ENSMUST00000157211 119 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm27694-201ENSMUST00000184740 86 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm29012-201ENSMUST00000187882 469 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm44877-201ENSMUST00000206485 274 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 AC138401.1-201ENSMUST00000221533 116 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm44846-201ENSMUST00000207127 3243 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Vmn2r67-201ENSMUST00000168730 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm16242-201ENSMUST00000117741 334 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm22956-201ENSMUST00000122520 80 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm13943-201ENSMUST00000144043 343 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm23053-201ENSMUST00000175136 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm24264-201ENSMUST00000179835 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm29429-201ENSMUST00000187071 121 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm43284-201ENSMUST00000200103 253 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm19177-201ENSMUST00000204520 613 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm37402-201ENSMUST00000194525 5000 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1293-ps-203ENSMUST00000217845 3628 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Mir466b-8-201ENSMUST00000103883 86 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm14448-201ENSMUST00000116383 210 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm23791-201ENSMUST00000122553 293 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm17186-201ENSMUST00000171742 456 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm43955-201ENSMUST00000204332 142 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 AC121598.3-201ENSMUST00000227179 1643 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1487-204ENSMUST00000216688 2038 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm9696-202ENSMUST00000191541 830 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm9402-201ENSMUST00000196849 388 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Igkv13-80-1-201ENSMUST00000197926 255 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm43600-201ENSMUST00000202134 223 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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