Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 AC134577.1-201ENSMUST00000227572 295 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm22868-201ENSMUST00000083955 164 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Olfr392-202ENSMUST00000144724 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Nlrp4f-201ENSMUST00000037372 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm14687-201ENSMUST00000120206 363 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm17779-201ENSMUST00000213395 394 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 AC154640.4-201ENSMUST00000226647 4640 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 4930533N22Rik-201ENSMUST00000206433 3509 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Olfr1231-202ENSMUST00000216144 3961 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Olfr1197-202ENSMUST00000213118 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm4479-201ENSMUST00000178807 171 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm44485-201ENSMUST00000199569 137 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 AC158537.2-201ENSMUST00000223575 150 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm26207-201ENSMUST00000082909 104 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Mmrn1-201ENSMUST00000129603 4477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 A930005H10Rik-202ENSMUST00000185424 433 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm4036-201ENSMUST00000220842 626 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Gm10037-202ENSMUST00000221266 549 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Mir34a-201ENSMUST00000083559 102 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd11P23813 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm10287-202ENSMUST00000180599 4059 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Cdc27-203ENSMUST00000106962 3160 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 0610010F05Rik-201ENSMUST00000043356 4392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Trav5d-3-201ENSMUST00000170041 270 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm26165-201ENSMUST00000083791 138 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Olfr270-204ENSMUST00000215127 3145 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Olfr729-203ENSMUST00000215327 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Olfr729-204ENSMUST00000215451 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm37176-201ENSMUST00000193300 4051 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms