Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Txndc9-204ENSMUST00000193832 3472 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm14636-202ENSMUST00000150801 5060 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r49-203ENSMUST00000226368 6276 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Olfr1404-203ENSMUST00000217374 3686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 A630033H20Rik-206ENSMUST00000180182 2997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Xrn1-202ENSMUST00000185633 10256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm31592-201ENSMUST00000217529 3471 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 Olfr1183-203ENSMUST00000219871 8353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 Gm26476-201ENSMUST00000122618 313 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 Gm25071-201ENSMUST00000175232 70 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 Gm27851-201ENSMUST00000183529 63 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 Gm18429-201ENSMUST00000198707 421 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 Zfp638-206ENSMUST00000203324 3822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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Chmp3Q9CQ10 AC121898.1-201ENSMUST00000227599 288 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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Chmp3Q9CQ10 Gm4746-201ENSMUST00000120395 2406 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r18-202ENSMUST00000228574 14315 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 Olfr392-201ENSMUST00000118463 3643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 Ntrk3-201ENSMUST00000039431 19703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r45-208ENSMUST00000228662 3309 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 Rian-201ENSMUST00000180876 8089 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 Olfr112-201ENSMUST00000085548 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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Chmp3Q9CQ10 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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Chmp3Q9CQ10 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 Gm37343-201ENSMUST00000192542 111 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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Chmp3Q9CQ10 Gm19366-201ENSMUST00000206996 156 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 AC152062.1-201ENSMUST00000218129 386 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 AC125379.1-201ENSMUST00000221928 111 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 AC126253.2-201ENSMUST00000226518 205 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 Olfr290-202ENSMUST00000214501 5196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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Chmp3Q9CQ10 Cyp3a13-201ENSMUST00000031741 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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Chmp3Q9CQ10 Gm42768-201ENSMUST00000197734 2897 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 Gm23322-201ENSMUST00000104464 167 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 n-R5s68-201ENSMUST00000122639 82 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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Chmp3Q9CQ10 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 Gm17159-201ENSMUST00000169043 482 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 Pcgf1-204ENSMUST00000176089 492 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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Chmp3Q9CQ10 Gm37431-201ENSMUST00000195102 111 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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Chmp3Q9CQ10 Vmn1r45-203ENSMUST00000227122 2861 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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Chmp3Q9CQ10 Gm23971-201ENSMUST00000083317 191 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 Mir28a-201ENSMUST00000083560 86 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 Gm23849-201ENSMUST00000083833 191 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 Gm26316-201ENSMUST00000083886 191 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 Znf41-ps-201ENSMUST00000122051 2413 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 Nlrp4d-201ENSMUST00000182420 2946 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 Gm8011-201ENSMUST00000172163 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r80-202ENSMUST00000227205 10892 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 Cyp3a25-201ENSMUST00000068317 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 Cngb3-201ENSMUST00000102999 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 Cd59b-204ENSMUST00000111132 436 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Chmp3Q9CQ10 Gm13307-201ENSMUST00000141375 493 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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