Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm25801-201ENSMUST00000082638 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Olfr65-201ENSMUST00000106864 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm7853-201ENSMUST00000100708 478 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm24596-201ENSMUST00000122504 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm24584-201ENSMUST00000157972 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm25211-201ENSMUST00000177553 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm24540-201ENSMUST00000177627 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm25256-201ENSMUST00000177746 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm22822-201ENSMUST00000177941 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Rnu6-201ENSMUST00000178023 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm23151-201ENSMUST00000178061 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm25245-201ENSMUST00000178139 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm24753-201ENSMUST00000178183 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm25829-201ENSMUST00000178275 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm22092-201ENSMUST00000178290 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm24486-201ENSMUST00000178420 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm23217-201ENSMUST00000178482 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm26245-201ENSMUST00000178491 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm23610-201ENSMUST00000178659 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm23092-201ENSMUST00000178688 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm25709-201ENSMUST00000178844 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm25547-201ENSMUST00000178877 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm25157-201ENSMUST00000178914 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm25312-201ENSMUST00000178972 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm24722-201ENSMUST00000179017 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm22969-201ENSMUST00000179018 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm25101-201ENSMUST00000179057 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm26378-201ENSMUST00000179093 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm24873-201ENSMUST00000179101 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm23934-201ENSMUST00000179111 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm22623-201ENSMUST00000179244 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm25737-201ENSMUST00000179274 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm22618-201ENSMUST00000179376 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm24182-201ENSMUST00000179419 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm24242-201ENSMUST00000179440 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm24863-201ENSMUST00000179499 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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