Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 RN7SL160P-201ENST00000468558 284 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC131233.1-201ENST00000479200 955 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 GOLGA6L5P-203ENST00000559768 578 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC023827.2-201ENST00000566880 1061 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC015923.1-202ENST00000581421 491 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AP002345.2-201ENST00000609961 904 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 TMC5-208ENST00000564959 2434 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 CFAP70-204ENST00000394865 1222 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 OSTN-AS1-201ENST00000430375 515 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 PFN2-217ENST00000498307 556 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC005899.3-201ENST00000580360 271 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC011591.1-201ENST00000591379 518 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms