Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm24056-201ENSMUST00000158617 146 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm43431-201ENSMUST00000198577 340 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm26430-201ENSMUST00000178054 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm9402-201ENSMUST00000196849 388 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm10088-201ENSMUST00000074116 423 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm5483-201ENSMUST00000114858 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm9377-201ENSMUST00000207227 623 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 AC153864.2-201ENSMUST00000220424 292 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Zfp846-201ENSMUST00000060063 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Olfr857-202ENSMUST00000212013 2306 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm24885-201ENSMUST00000158783 270 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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