Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Olfr747-204ENSMUST00000213238 1416 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Olfr609-203ENSMUST00000216360 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm3956-201ENSMUST00000164882 2560 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Vmn2r36-201ENSMUST00000170402 2561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm6071-201ENSMUST00000119561 440 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm15733-201ENSMUST00000132957 242 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm8289-201ENSMUST00000144814 1182 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm26195-201ENSMUST00000175035 101 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Mir6383-201ENSMUST00000184545 116 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm29192-201ENSMUST00000190942 377 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm43475-201ENSMUST00000196673 400 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm30674-201ENSMUST00000214523 392 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 AC134577.1-201ENSMUST00000227572 295 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1459-201ENSMUST00000078299 1102 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm20345-201ENSMUST00000175839 2414 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1211-203ENSMUST00000213412 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1447-203ENSMUST00000216989 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Zfp131-202ENSMUST00000178271 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Mir687-201ENSMUST00000102166 89 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm24890-201ENSMUST00000104389 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Mir291a-201ENSMUST00000104815 82 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm14518-201ENSMUST00000117351 542 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm11456-201ENSMUST00000121070 256 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm27510-201ENSMUST00000158214 64 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm24552-201ENSMUST00000158646 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Slco1a4-203ENSMUST00000165990 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Mir6338-201ENSMUST00000183389 109 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm28358-202ENSMUST00000189292 223 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm28155-201ENSMUST00000191066 151 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm8242-202ENSMUST00000193056 475 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm43746-201ENSMUST00000200028 317 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm43415-201ENSMUST00000201934 750 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm29674-202ENSMUST00000219664 4083 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1484-205ENSMUST00000216369 3764 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Dmd-203ENSMUST00000114000 14910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 1700008H02Rik-201ENSMUST00000201220 1684 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm14416-201ENSMUST00000118630 2308 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1314-202ENSMUST00000207976 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Fnd3c2-201ENSMUST00000091282 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm12276-201ENSMUST00000121709 301 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm12958-201ENSMUST00000141242 674 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm22792-201ENSMUST00000157225 133 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm24730-201ENSMUST00000158228 117 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm22516-201ENSMUST00000158266 124 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm25748-201ENSMUST00000175487 70 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms