Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm42585-201ENSMUST00000198731 4020 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm13092-201ENSMUST00000136346 260 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm22177-201ENSMUST00000175002 158 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm26219-201ENSMUST00000175216 71 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Mir6917-201ENSMUST00000184111 61 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm35865-201ENSMUST00000220180 287 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm10484-201ENSMUST00000196372 4759 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Vmn1r71-205ENSMUST00000227940 4725 ntAPPRIS P2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm44435-201ENSMUST00000204379 4119 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Traj34-201ENSMUST00000103707 58 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm22590-201ENSMUST00000104247 128 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 AC155921.1-201ENSMUST00000216568 3841 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 AC152162.1-201ENSMUST00000225910 2917 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm44525-201ENSMUST00000183129 2634 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm7957-201ENSMUST00000207404 2602 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm24553-201ENSMUST00000158653 131 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Atp2b4-207ENSMUST00000165602 8101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 4932414N04Rik-204ENSMUST00000128259 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Zfp715-202ENSMUST00000048015 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm1992-201ENSMUST00000161581 250 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm26499-201ENSMUST00000178544 79 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm26096-201ENSMUST00000179084 79 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Olfr101-203ENSMUST00000215392 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 AC156560.3-201ENSMUST00000222978 3841 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Olfr1252-203ENSMUST00000216203 3243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm43885-201ENSMUST00000204928 2542 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm37397-201ENSMUST00000194579 2842 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Igkv4-69-201ENSMUST00000103349 348 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm14697-201ENSMUST00000147144 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm23672-201ENSMUST00000157471 107 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms