Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm43925-201ENSMUST00000203498 206 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Olfr406-203ENSMUST00000217016 2651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm8473-201ENSMUST00000176697 1885 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Nlrp4f-204ENSMUST00000221659 3551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Nexn-212ENSMUST00000199470 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm37814-201ENSMUST00000195820 3644 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Pcsk2os2-201ENSMUST00000153878 3370 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Elavl4-204ENSMUST00000106598 3997 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Ktn1-201ENSMUST00000022391 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm8666-201ENSMUST00000117517 292 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm13567-201ENSMUST00000118026 247 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm12571-201ENSMUST00000118132 243 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm12252-201ENSMUST00000119517 219 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm9003-201ENSMUST00000121810 482 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm24503-201ENSMUST00000158454 135 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm14419-204ENSMUST00000178182 192 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm2004-202ENSMUST00000178872 192 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm14295-203ENSMUST00000179435 192 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm19774-201ENSMUST00000190667 114 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 AC124739.2-201ENSMUST00000222201 109 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Vmn1r217-203ENSMUST00000228656 9767 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Zfp950-204ENSMUST00000143264 4825 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Slfn8-201ENSMUST00000038141 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Svet1-201ENSMUST00000209370 3940 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Olfr128-202ENSMUST00000216440 3644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Olfr136-202ENSMUST00000208525 2534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Abi3bp-203ENSMUST00000096013 4495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm31371-201ENSMUST00000211848 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 B230206I08Rik-201ENSMUST00000207479 3191 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Trav8-1-201ENSMUST00000103643 328 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm23746-201ENSMUST00000104229 125 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm28830-201ENSMUST00000188192 213 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 CT030242.2-201ENSMUST00000221588 148 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Vmn2r31-201ENSMUST00000075108 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Olfr536-205ENSMUST00000215768 4231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Kctd12b-202ENSMUST00000112572 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Atad1-201ENSMUST00000070210 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm4631-202ENSMUST00000121393 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Cybb-201ENSMUST00000015484 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm44542-201ENSMUST00000208677 4314 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Fnd3c2-201ENSMUST00000091282 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Zfp458-204ENSMUST00000225772 3485 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm28650-201ENSMUST00000188413 411 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm43853-201ENSMUST00000197162 301 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Zfp715-202ENSMUST00000048015 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm3623-201ENSMUST00000173643 2747 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 AC158921.1-201ENSMUST00000227861 3468 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Cmah-206ENSMUST00000167746 9727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Cd200r3-209ENSMUST00000166731 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Ccser2-201ENSMUST00000067700 7334 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm43300-201ENSMUST00000198540 2043 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm25420-201ENSMUST00000104216 127 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm13737-201ENSMUST00000119793 232 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm13686-201ENSMUST00000122851 350 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Cox6b2-206ENSMUST00000182738 423 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm27222-201ENSMUST00000183398 427 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm17966-201ENSMUST00000193453 594 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Smcp-202ENSMUST00000194965 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Rpl18a-ps2-201ENSMUST00000197158 174 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Igkv14-118-2-201ENSMUST00000198287 339 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm25592-201ENSMUST00000082635 131 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm25634-201ENSMUST00000082667 105 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 n-R5s54-201ENSMUST00000083837 112 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm13630-201ENSMUST00000127849 3650 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm44724-201ENSMUST00000207119 5548 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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