Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm24235-201ENSMUST00000104319 129 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm16289-201ENSMUST00000162079 183 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm28155-201ENSMUST00000191066 151 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Nap1l1-202ENSMUST00000171797 3926 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Nap1l1-204ENSMUST00000218828 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Abi3bp-204ENSMUST00000171000 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm23477-201ENSMUST00000158882 128 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm2522-201ENSMUST00000204280 322 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Olfr575-203ENSMUST00000216420 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Cdh7-209ENSMUST00000172005 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm22089-201ENSMUST00000158336 102 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm24878-201ENSMUST00000158782 104 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm24331-201ENSMUST00000175099 67 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Mir3064-201ENSMUST00000175532 67 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm23801-201ENSMUST00000175561 67 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm24485-201ENSMUST00000178283 67 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Mpc1-ps-201ENSMUST00000181662 330 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm27568-201ENSMUST00000184220 99 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 AC157278.1-201ENSMUST00000221621 148 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Mir215-201ENSMUST00000083628 112 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Sfmbt2-205ENSMUST00000116594 7821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Vmn1r45-208ENSMUST00000228662 3309 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm43829-201ENSMUST00000196191 3802 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm14288-201ENSMUST00000109020 3438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 3110080E11Rik-201ENSMUST00000210736 3477 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Eya4-208ENSMUST00000220299 3615 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm13687-201ENSMUST00000119857 282 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm25870-201ENSMUST00000179845 79 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm5829-201ENSMUST00000191383 351 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm46998-201ENSMUST00000221444 330 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 AC174459.2-201ENSMUST00000226036 160 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm43958-201ENSMUST00000204360 3544 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm11598-201ENSMUST00000119257 357 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Tarbp2-207ENSMUST00000142114 420 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm28786-201ENSMUST00000187228 172 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd11P23813 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms