Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Cfh-206ENSMUST00000192880 3746 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Olfr1500-204ENSMUST00000215760 2305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm21034-201ENSMUST00000207390 2608 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Fscb-201ENSMUST00000059833 3361 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm13687-201ENSMUST00000119857 282 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm26097-201ENSMUST00000179642 93 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 AC153979.1-201ENSMUST00000219684 242 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Mir137-201ENSMUST00000083635 73 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Mbnl1-219ENSMUST00000194201 4319 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm10484-201ENSMUST00000196372 4759 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Olfr810-204ENSMUST00000217283 4527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 AC159193.2-201ENSMUST00000220865 4251 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Ptprc-203ENSMUST00000182283 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gmnc-201ENSMUST00000089832 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm22498-201ENSMUST00000104497 86 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm11471-201ENSMUST00000121824 198 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm23666-201ENSMUST00000158053 116 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm10357-201ENSMUST00000159886 264 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm19244-201ENSMUST00000204340 253 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm23736-201ENSMUST00000082553 75 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Mir338-201ENSMUST00000083666 98 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Vmn2r31-201ENSMUST00000075108 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Hfm1-201ENSMUST00000112690 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Btbd35f5-201ENSMUST00000179538 1950 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Vmn1r89-202ENSMUST00000226717 4120 ntAPPRIS P2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm21940-201ENSMUST00000204940 2278 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm25272-201ENSMUST00000104293 128 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm13867-201ENSMUST00000120844 395 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm5391-201ENSMUST00000121155 613 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 4921501E09Rik-201ENSMUST00000024121 3916 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Olfr1255-202ENSMUST00000214508 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Klhl13-201ENSMUST00000035973 2996 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Olfr836-202ENSMUST00000212730 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Olfr836-203ENSMUST00000215981 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Igkv7-33-201ENSMUST00000103376 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm13167-201ENSMUST00000118554 578 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm28932-201ENSMUST00000186300 357 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm46138-201ENSMUST00000215294 426 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm43751-201ENSMUST00000200275 3071 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Kctd12b-201ENSMUST00000039424 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm37045-201ENSMUST00000192016 2463 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Olfr1484-203ENSMUST00000215567 3699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm37011-201ENSMUST00000195543 2935 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Olfr1477-201ENSMUST00000214274 3913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm22516-201ENSMUST00000158266 124 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm2862-201ENSMUST00000161524 328 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm17218-201ENSMUST00000165911 410 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm37791-201ENSMUST00000195081 286 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Olfr128-202ENSMUST00000216440 3644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Olfr711-202ENSMUST00000207200 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ecm2Q5FW85 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ecm2Q5FW85 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ecm2Q5FW85 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ecm2Q5FW85 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ecm2Q5FW85 n-R5s219-201ENSMUST00000104328 132 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ecm2Q5FW85 Gm12683-201ENSMUST00000117528 415 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ecm2Q5FW85 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ecm2Q5FW85 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ecm2Q5FW85 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ecm2Q5FW85 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ecm2Q5FW85 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ecm2Q5FW85 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ecm2Q5FW85 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ecm2Q5FW85 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms