Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Catsperg1-212ENSMUST00000169143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Postn-203ENSMUST00000107985 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm42910-201ENSMUST00000198917 2921 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Cp-203ENSMUST00000108325 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm23481-201ENSMUST00000104173 131 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 CT010444.1-201ENSMUST00000219963 3845 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Olfr1130-202ENSMUST00000216580 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Osbpl6-201ENSMUST00000077972 8037 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Zfp595-201ENSMUST00000109735 3896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm3259-201ENSMUST00000101015 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Vmn2r59-201ENSMUST00000168489 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Traj12-201ENSMUST00000103729 58 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm25436-201ENSMUST00000158275 145 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm43899-201ENSMUST00000203675 246 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 AC123064.1-201ENSMUST00000218950 406 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm37562-201ENSMUST00000194763 4328 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm14299-201ENSMUST00000117586 397 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm26369-201ENSMUST00000157825 100 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm25300-201ENSMUST00000175284 84 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 AC126673.1-201ENSMUST00000223208 3856 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Olfr13-202ENSMUST00000216179 3677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Plce1-201ENSMUST00000169713 9439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm37345-201ENSMUST00000193062 3138 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm26276-201ENSMUST00000157099 109 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm24908-201ENSMUST00000157294 127 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm22732-201ENSMUST00000158093 121 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Plch1-202ENSMUST00000059973 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm5591-201ENSMUST00000079759 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd11P23813 Vmn1r22-202ENSMUST00000227650 3674 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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