Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm28163-201ENSMUST00000187099 325 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm46136-201ENSMUST00000214730 565 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 AC113031.4-201ENSMUST00000228381 514 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm14931-201ENSMUST00000111079 253 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm25051-201ENSMUST00000158602 249 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm37771-201ENSMUST00000193121 265 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm23645-201ENSMUST00000083228 108 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm23741-201ENSMUST00000097237 171 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm14899-201ENSMUST00000118673 548 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm14359-201ENSMUST00000118883 424 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm14360-201ENSMUST00000120670 393 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm23043-201ENSMUST00000157890 109 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm6395-201ENSMUST00000167639 691 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm37778-201ENSMUST00000191732 190 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Mir7118-201ENSMUST00000197760 61 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm30275-202ENSMUST00000198124 416 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm18242-201ENSMUST00000218455 542 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Tslp-201ENSMUST00000025237 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Pdcd10-201ENSMUST00000029424 907 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm15067-201ENSMUST00000119534 156 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm2768-201ENSMUST00000121062 250 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm22793-201ENSMUST00000157227 330 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ggta1P23336 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms