Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm25624-201ENSMUST00000157222 275 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm8338-201ENSMUST00000163928 363 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm45860-201ENSMUST00000212700 334 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Olfr1114-ps1-201ENSMUST00000213896 456 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Olfr895-201ENSMUST00000093864 951 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm14440-202ENSMUST00000109051 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm15084-201ENSMUST00000178585 1502 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm15760-201ENSMUST00000119553 283 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 AC153564.2-201ENSMUST00000219464 273 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm23136-201ENSMUST00000083425 99 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Olfr498-201ENSMUST00000217616 2260 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm14647-201ENSMUST00000119392 680 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 n-R5s80-201ENSMUST00000122596 111 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm33354-201ENSMUST00000195448 906 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 AC107757.3-201ENSMUST00000226312 535 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Olfr124-203ENSMUST00000216478 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Olfr1186-202ENSMUST00000215912 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm12412-201ENSMUST00000121867 328 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm15521-201ENSMUST00000141752 835 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Mir8106-201ENSMUST00000184520 139 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 AC161426.1-201ENSMUST00000214137 286 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Olfr937-201ENSMUST00000055567 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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