Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Olfr677-202ENSMUST00000213204 3227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 A430106G13Rik-201ENSMUST00000182158 3388 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Trav12d-2-201ENSMUST00000103593 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Trav12n-2-201ENSMUST00000103619 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm24581-201ENSMUST00000103962 133 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm23528-201ENSMUST00000104571 132 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Rps15a-ps7-201ENSMUST00000117430 392 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm12423-201ENSMUST00000118334 135 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm43668-201ENSMUST00000197014 5342 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Tdo2-201ENSMUST00000029645 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm25169-201ENSMUST00000104190 129 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm22725-201ENSMUST00000158092 110 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm25438-201ENSMUST00000158281 110 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 AC153553.1-201ENSMUST00000218257 684 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm14696-201ENSMUST00000144294 3976 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm15772-201ENSMUST00000118533 438 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm17571-201ENSMUST00000167906 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 H2al1k-201ENSMUST00000178196 510 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Mir6914-201ENSMUST00000184999 69 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Lpp-201ENSMUST00000038053 15647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Cyp3a25-201ENSMUST00000068317 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Glce-203ENSMUST00000185675 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm5581-201ENSMUST00000072940 2550 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm24384-201ENSMUST00000122693 75 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm26357-201ENSMUST00000158218 115 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Olfr1269-203ENSMUST00000216493 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Osbpl6-202ENSMUST00000111929 8257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Arhgap18-201ENSMUST00000039557 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Gm37204-201ENSMUST00000192389 3961 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd11P23813 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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