Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm24984-201ENSMUST00000104454 133 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm14868-201ENSMUST00000117840 216 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm23032-201ENSMUST00000157995 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm24754-201ENSMUST00000177997 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm44133-201ENSMUST00000203823 701 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm9068-201ENSMUST00000217393 455 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Mup-ps14-201ENSMUST00000118437 532 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm24056-201ENSMUST00000158617 146 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm23648-201ENSMUST00000180301 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm38044-201ENSMUST00000192964 487 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 AC152951.1-201ENSMUST00000218907 266 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Olfr1454-201ENSMUST00000073732 924 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm14932-201ENSMUST00000117112 453 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm12044-201ENSMUST00000120335 213 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm3025-201ENSMUST00000163454 489 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm2878-201ENSMUST00000170173 486 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm45636-201ENSMUST00000210497 1064 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 AC122225.1-201ENSMUST00000215641 369 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Olfr1005-ps1-201ENSMUST00000216207 488 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Tas2r123-201ENSMUST00000071696 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Rpl10-ps4-201ENSMUST00000117120 286 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm15452-201ENSMUST00000119877 240 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm25194-201ENSMUST00000177987 79 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
Ggta1P23336 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms