Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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