Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP8

Vmn1r10, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r10W4VSP8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r10W4VSP8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms