Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Top3bQ9Z321 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms