Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac5Q9Z2V6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac5Q9Z2V6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac5Q9Z2V6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac5Q9Z2V6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac5Q9Z2V6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac5Q9Z2V6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac5Q9Z2V6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac5Q9Z2V6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac5Q9Z2V6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hdac5Q9Z2V6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hdac5Q9Z2V6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hdac5Q9Z2V6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hdac5Q9Z2V6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hdac5Q9Z2V6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms