Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms