Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Upk1bQ9Z2C6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Upk1bQ9Z2C6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Upk1bQ9Z2C6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Upk1bQ9Z2C6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Upk1bQ9Z2C6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Upk1bQ9Z2C6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Upk1bQ9Z2C6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Upk1bQ9Z2C6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk1bQ9Z2C6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms