Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms