Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Cldn7Q9Z261 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Cldn7Q9Z261 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Cldn7Q9Z261 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms