Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms