Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Sh3bp5Q9Z131 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp5Q9Z131 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Sh3bp5Q9Z131 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Sh3bp5Q9Z131 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Sh3bp5Q9Z131 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp5Q9Z131 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp5Q9Z131 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp5Q9Z131 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp5Q9Z131 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp5Q9Z131 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp5Q9Z131 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Sh3bp5Q9Z131 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp5Q9Z131 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp5Q9Z131 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp5Q9Z131 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp5Q9Z131 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp5Q9Z131 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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