Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0L3

Oc90, Otoconin-90, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oc90Q9Z0L3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Oc90Q9Z0L3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms