Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms