Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms